Par respect de la tradition et pour l'authenticité du goût, les troupeaux sélectionnés pour la production du Reblochon sont composés exclusivement de 3 races montagnardes, Abondance, Tarine et Montbéliarde. Leur alimentation est entièrement naturelle (herbe pâturée pendant la période estivale et foin distribué à volonté en période hivernale) et exclut toute forme d'alimentation fermentée, ce qui renforce l'influence de la flore des alpages. Les conditions climatiques influent sur le déplacement des troupeaux. Généralement sorties de l'étable début mai, les bêtes montent courant juin en alpage après avoir pâturé dans le bas de la vallée. Elles resteront en altitude jusqu'au début du mois d'octobre, puis elles regagneront les étables afin d'y passer l'hiver.